Hřbitovní kostel byl vystavěn v letech 1613–1614 jako špitální kostel a až na několik menších úprav si ponechal svou původní podobu dodnes (krov je díky dendrochronologické analýze datován k roku 1614). Stavba je fundací velvarských měšťanů, kteří svěřili její realizaci místnímu měšťanu, architektu Santinimu Malvazione. Jedná se o jednolodní kostel s polokruhovým presbytářem, k němuž se z východu přimyká čtvercová sakristie. Stavba má z formálního hlediska převážně pozdně gotický charakter (opěráky, vysoká mírně lomená okna s kružbami), doplněný nicméně o renesační stavební i výzdobné prvky (západní štít, pilastry lodi). Významnou dominantou interiéru je tříramenná kamenná empora s dřevěnou patrovou nástavbou a s točitým schodištěm.

Loď kostela je zaklenuta valenou klenbou zdobenou hvězdovým vzorem tažených štukových žeber. Žebra vybíhají z kamenných patních konzol přístěnných pilastrů, které jsou zdobeny reliéfy v podobě andílčích hlaviček či ovocných festonů. Kostel byl původně ornamentálně vymalován, na klenbě je dodnes patrný znak města Velvar a krále Matyáše. Stavba je dále zajímavá jemně zpracovanými kamennými výzdobnými články mj. v podobě akantových rozvilin, které se nacházejí na západním štítu, opěrných pilířích i reliéfní exteriérové římse.